具体而言，现有城乡土地制度与相关体制改革的局限性表现在如下几个方面。
一是与城乡土地制度改革紧密相关的户籍改革目前仍停留在主要依靠地方政府自行推动的阶段，“农民工市民化”与“人口完全城市化”的进展明显不足。
二是在传统农区的土地制度改革上，农地产权稳定与宅基地利用仍然面临巨大挑战。
三是在不推动城市土地供给制度改革的前提下，中央政府的房价调控政策并不利于房地产市场的正常运作和健康发展，而多轮宏观刺激下还出现了人口流入地城市房价的过快上升与住房供应严重不足，而人口流出地城市住房供应严重过剩的局面，这更进一步提高了人口流入地主要城市“农民工市民化”和“流动人口完全城市化”的难度。
四是虽然征地制度改革提高了地方政府征地的公益性要求，但过高的公益用地比例门槛可能带来多方都不乐见的结果。
五是集体经营性建设用地入市面临地方政府以城市规划和土地用途管制方式施加的约束，前景并不乐观。
六是我国既有的耕地保护政策难以有效实现耕地保护的质量目标，也导致土地发展权指标跨区配置的低效率。在耕地保护上，中央通过“农转用”计划管理和分级审批制度控制耕地占用，并划定了永久基本农田保护区，同时推动了“耕地占补平衡”政策。
一是与城乡土地制度改革紧密相关的户籍改革目前仍停留在主要依靠地方政府自行推动的阶段，“农民工市民化”与“人口完全城市化”的进展明显不足。
二是在传统农区的土地制度改革上，农地产权稳定与宅基地利用仍然面临巨大挑战。
三是在不推动城市土地供给制度改革的前提下，中央政府的房价调控政策并不利于房地产市场的正常运作和健康发展，而多轮宏观刺激下还出现了人口流入地城市房价的过快上升与住房供应严重不足，而人口流出地城市住房供应严重过剩的局面，这更进一步提高了人口流入地主要城市“农民工市民化”和“流动人口完全城市化”的难度。
四是虽然征地制度改革提高了地方政府征地的公益性要求，但过高的公益用地比例门槛可能带来多方都不乐见的结果。
五是集体经营性建设用地入市面临地方政府以城市规划和土地用途管制方式施加的约束，前景并不乐观。
六是我国既有的耕地保护政策难以有效实现耕地保护的质量目标，也导致土地发展权指标跨区配置的低效率。在耕地保护上，中央通过“农转用”计划管理和分级审批制度控制耕地占用，并划定了永久基本农田保护区，同时推动了“耕地占补平衡”政策。